Quedó huérfano de madre con un año de edad y fueron sus hermanas las que lo criaron y le enseñaron las primeras letras. Posteriormente estudia gramática, latín y griego bajo la supervisión del párroco de Touriñán, que tenía una Escuela de Gramática en Vilela de Nemiña. Entre 1847 y 1848 marchó a Santiago donde inició los estudios de bachillerato. Víctima de una larga enfermedad, tiene que volver a Ponteceso haciendo por libre los cursos necesarios para acabar el bachillerato. En el año 1860 acaba la carrera de Medicina en Santiago de Compostela. Se presentó a unas oposiciones convocadas por el Cuerpo de Sanidad Militar el 16 de marzo de 1863 y fue destinado como segundo ayudante médico a la fábrica de fundición y armas de Trubia en Asturias. Pero pronto abandonó la sanidad siendo dado de baja como facultativo del cuerpo de Sanidad Militar para dedicarse definitivamente a la poesía. Con motivo de los primeros Juegos Florales de Galicia, el 2 de julio de 1861 aparece publicado en El Álbum de la Caridad el primer poema de Pondal escrito en gallego titulado A Campana de Anllóns. Es un poema lleno de melancolía en el que expresa un gran amor por la tierra. Esta primera edición contaba sólo con 12 estrofas, pero en 1895 sería publicado en A Coruña con ochenta y uno.
OBRADesde el año 1861, Eduardo Pondal escribiría en gallego o castellano según las circunstancias. De esta época es el comienzo de un famoso proyecto de creación de un extenso poema épico titulado A América descuberta. Este poema se llamaría más tarde Colón y finalmente quedaría con el nombre Os Eoas. Pondal no llegó a publicar este poema y en él aparece claramente la influencia de la obra Os Lusiadas de Camoens. En 1877 publicó su primer libro, titulado Rumores de los pinos, compuesto de poesías en gallego y castellano. Después de la publicación de este libro ya no volvería a escribir poesía en castellano. pero en 1886 se publica en A Coruña Queixumes dos pinos, que no sólo es una extensión del anterior sino que supone una superación desde el punto de vista ideológico, artístico y lingüístico. En este nuevo libro, Pondal incluyó algunos poemas del primero, que ya estaban en gallego, y tradujo otros que ganaron en valor estético. Ya después de su muerte, la Real Academia Gallega sacaría a la luz en el año 1935 un segundo Queixumes dos pinos, que incluía 38 poemas más, unos inéditos y otros desconocidos.OTRAS ACTIVIDADES:Colaboró asiduamente en varias revistas de ámbito nacional e internacional como Revista de las Provincias, Boletín de la Biblioteca-Museo Balaguer, la España Regional y en otras muchas que se publicaban en América. Fue socio de número de la Academia Gallega. En el año 1900 fue nombrado socio de mérito por la Sociedad Económica de Amigos del País de Santiago en reconocimiento de los valores artísticos de su obra. En 1910 recibe también el título de académico honorario por la Academia de la Poesía Española.
Se le dedicó el Día de las Letras Gallegas en el año 1965.